На процес заселення Примор'я, на його економічний і соціально-політичний розвиток істотний вплив робили політика російського уряду і міжнародна ситуація в Азіатсько-Тихоокеанському регіоні. У кінці Х1Х ст. інтереси російської далекосхідної політики все більше зосереджувалися на розділі Китаю, наслідком цього стало будівництво КВЖД, передача Росії в оренду південній частині Ляодунського півострова і Порт-Артура, що призвело до погіршення відносин між Росією та Японією і до інших серйозних наслідків: десятки мільйонів рублів потекли на будівництво Далекого і Порт-Артура, куди з Владивостока була перебазований Тихоокеанська ескадра, в Південно-Уссурійському краї припинені оборонні роботи і т.д.
Обороноздатність Далекого Сходу Росії.
Напередодні війни з Японією обороноздатність далекосхідних рубежів Росії була надзвичайно низької. Через незакінченості будівельних робіт на Транссибірською магістраллю, брак паровозів і вагонів пропускна здатність Транссибу і КВЖД була невелика: 6-8 військових ешелонів на добу. Військовий вантаж з Петербурга і Москви слідував до Владивостока майже 50 діб. Для перекидання військ на далекосхідний театр війни було потрібно кілька місяців. 98 тис. російських регулярних військ і 24 тис. добровольців і козаків прикордонної варти протистояли на Далекому Сході 151 тис. навчених кадрових солдат японської імператорської армії. Ні кількість військ, ні кількість бойової підготовки не відповідали потребам оборони краю. До того ж тил російської армії дезорганізували хунхузи - збройні китайські банди.
Фортеця Владивосток.
До Владивостока і Південно-Уссурійський край війська і військові припаси доставлялися в останню чергу, оскільки основні бойові дії очікувалися, а потім і проходили в Південній Маньчжурії і в районі Порт-Артура.
Головна сухопутна оборонна лінія проходила в 3 - 6 км. від Владивостока. Вона складалася з 4 фортів, 3 тимчасових укріплень, 5 редутів і 12 батарей; в стадії будівництва знаходилися 4 батареї. Берегова та фортечна артилерія мала на озброєнні в основному застарілі системи. Фортеця захищали нарізні сталеві гармати зразка 1877 р. - з малою дальністю, невисокою скорострільністю і недостатньою точністю стрільби. Гарнізон фортеці налічував 17 тис. осіб. Цього було явно недостатньо для оборони 63 верст периметра кріпаків позицій.
У ніч на 27 січня 1904 р. японський флот раптово напав на російську ескадру на зовнішньому рейді Порт-Артура. У корейському порту Чемульпо були атаковані крейсер "Варяг" і канонерський човен "Кореєць". Моряки "Варяг" билися та загинули в бою 27 січня 1904
12 лютого 1904 японська ескадра в состтаве 10 кораблів підійшла до острова Російська, але, не зробивши жодного пострілу, пішла назад. На світанку 22 лютого російські наглядові пости знову виявили в затоці Петра Великого, на південь від острова Аскольд, 7 японських крейсерів - 5 броненосних і 2 легких. У 8ч. 50 хв. на прапор-щоглі гори тигровій замайорів червоний прапорець - сигнал тривоги. Звістка про наближення ворожої ескадри швидко рознеслася по Владивостоку.
Залишивши легкі крейсера біля острова Аскольд, броненосні крейсера підійшли до півострова Басаргіна, і в 13ч. 30 хв. головний корабель відкрив вогонь з гармат. Потім вся ескадра попрямувала вздовж берега. Протягом години японці випустили близько 200 снарядів. Обстрілу зазнали будуються форти Суворова і Ліневича, берегові батареї, східна частина міста і порту. Російські крейсери стали розводити пари, щоб вийти назустріч японської ескадрі, але противник зник за горизонтом. Збиток обстрілу був невеликий. Фортечні споруди не постраждали, а в місті ушкодження були також незначні. У той же день наказом коменданта фортеці Владивосток був оголошений у стані облоги.
Військові дії на морі.
30 липня 1904 броненосні крейсера "Росія", "Рюрик" і "Громобій" вийшли з Владивостока до Корейського протокою на допомогу портартурской ескадрі, не знаючи про те, що вона розбита ще 28 липня. 1 серпня на місці передбачуваної зустрічі з російською ескадрою владивостоцькі крейсера чекала японська ескадра Камімури, що перевершувала за кількістю кораблів, артилерійської потужності і швидкості ходу. Через годину бою "Рюрик" втратив керування, але продовжував битися. Отримавши великі пошкодження "Росія" і "Громобій" намагалися взяти вогонь на себе, щоб дати можливість "Рюрика" виправити рульове управління. На п'ятій годині бою командуючий загоном контр-адмірал Иессен вирішив відходити до Владивостока, щоб врятувати два, що залишилися крейсера. "Рюрик" виявився оточений 4 броненосними і 2 легкими крейсерами противника. Чинити опір він вже не міг. Всі знаряддя замовкли. З 800 членів екіпажу більше половини були убиті і поранені. Командир крейсера і старший офіцер були смертельно поранені ще на початку бою. Лейтенант К. С. Іванов наказав відкрити кінгстони. "Рюрик" повільно занурився в морську пучину.
Хід війни на суші. Оборона Порт-Артура.
Блокада Порт-Артура і Тихоокеанської ескадри дозволила японцям майже безперешкодно перекидати війська на материк.
З прибуттям на Далекий Схід нового командувача флотом віце-адмірала С. О. Макарова активність російської ескадри у Порт-Артурі зросла. С. О. Макаров був відомий як учений, творець теорії непотоплюваності карабля, океанограф-дослідник арктичних морів і Тихого океану. Загибель адмірала С. О. Макарова 31 березня 1904 на флагманському броненосці "Петропавловськ" явилась великою втратою для російського флоту.
В кінці квітня-початку травня 1904 почалися активні бойові дії на суші. Японська армія, що перевершувала російську за чисельністю, підготовці, що мала можливість використовувати резерви, завдавала російським військам поразку за поразкою. Героїзм солдатів, стройових офіцерів і окремих частин не міг змінити хід війни.
Біля стін Порт-Артура була зібрана 100-тисячна армія японців. Під керівництвом начальника оборони сухопутного фронту Порт-Артура генерала Р. І. Кондратенко захисники фортеці за півроку облоги відбили 4 штурму. Людина великої особистої хоробрості, великий військовий фахівець, генерал постійно перебував на фортах і в траншеях. Разом зі своїм штабом Р. І. Кондратенко загинув при артилерійському обстрілі.
Незважаючи на те, що можливості оборони фортеці не були вичерпані, 20 грудня 1904 Порт-Артур капітулював.
Закінчення війни.
Тим часом на посилення російської Тіххокеанской ескадри з Балтики йшла 2-а Тихоокеанська ескадра під командуванням віце-адмірала З. П. Синє., Зібрана з кораблів різних років споруди, ступеня озброєності та бронювання. 14 травня 1905 ескадра адмірала Х. Того зустріла росіян в Корейській протоці. У результаті дводенного бою російський флот був вщент розгромлений.
Військові поразки і що почалася в країні революція змусили уряд Росії шукати мирний шлях вирішення конфлікту з Японією. Японія теж втомилася від війни. Підписання довгоочікуваного світу відбулося 23 серпня 1905 р. в місті Портсмут (США). Російська делегація погодилася з умовами японської сторони. Росія поступилася південну частину Сахаліну і відмовилася на користь Японії від оренди Ляодунського півострова з Порт-артерії і портом Далекий.